1932年，9岁的冯其庸入读无锡县立前洲小学。1937年因日寇全面侵华小学停办而失学。耕作之余刻苦自学，一本无法还给学校的《三国演义》，竟成唯一读本，几能成诵。辍学而又好读的冯其庸四处求书，借得的20余本典籍读本成为烛照其童年生活的光亮。在阅读、书写、绘画中，冯其庸主要凭借自学完成了最初的知识积淀。1940年，17岁的冯其庸考入无锡私立青城中学。

1943年下半年，冯其庸考入省立无锡工业专科学校。期间得到无锡著名画家诸健秋赏识，受到点拨影响。1944年7月，冯其庸因贫失学，先后任教于前洲小学、无锡孤儿院小学。1945年苏州美专迁至无锡，素喜绘画的冯其庸前往应试，以素描、作文两科的优异成绩被录取。冯其庸本想边工作边学习，以薪资充任学费。但天不遂人愿，两个月后苏州美专因故迁回苏州，冯其庸因无力承担学费和异地生活费用，只得含泪放弃。是为他的第三次失学。